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TBtools 多功能生物信息可视化集成平台培训课程

TBtools 多功能生物信息可视化集成平台培训课程

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  • 培训对象:植物科学研究人员、非模式生物研究者、湿实验科学家、需要便捷的生物信息分析工具且编程经验有限的科研人员。

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  • 培训目标

    1. 掌握TBtools的安装与界面操作,能够利用图形界面完成常见的生物信息分析任务。

    2. 熟练使用序列提取、格式转换、基因结构可视化等核心功能,加速日常数据处理。

    3. 掌握基因家族分析、共线性分析等高级应用,能够独立完成基因家族研究的全套流程

  • 培训内容介绍

    1. TBtools平台概览:了解TBtools作为国产多功能生物信息工具的发展历程,熟悉菜单结构与功能分类。

    2. 安装与环境配置:安装Java运行环境,下载TBtools并完成基础配置,熟悉插件管理。

    3. 序列数据处理:使用序列提取工具从基因组中提取CDS、蛋白序列或指定区域序列

    4. 格式转换工具:在GFF/GTF、BED、FASTA等多种格式间进行转换,适应不同软件输入要求。

    5. 基因结构可视化:根据GFF注释和序列信息,绘制包含外显子-内含子结构的基因结构图

    6. 染色体分布绘制:将基因位置信息映射到染色体示意图上,展示基因的染色体分布

    7. Blast比对与结果处理:在TBtools中运行本地Blast,对Blast结果进行筛选和可视化。

    8. 保守结构域分析:集成Pfam/InterProScan,对候选基因进行保守结构域鉴定与可视化

    9. 基因家族成员鉴定:结合Blast和结构域筛选,完成目标物种中特定基因家族成员的鉴定流程

    10. 多序列比对与motif分析:进行多序列比对,使用MEME Suite识别保守motif并可视化

    11. 共线性分析:进行物种内或物种间的共线性分析,绘制共线性圈图或点图

    12. 综合实战演练:以基因家族研究为例,完成从序列获取、成员鉴定到多图组合发表的全流程。





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