生物信息序列分析基础与实战培训课程-中科信软培训中心

生物信息序列分析基础与实战培训课程

培训对象：生物医学研究人员、临床检验人员、生物技术企业研发人员、需要掌握高通量测序数据处理流程的初学者。
培训目标：
1. 理解高通量测序数据的基本格式与质量评估方法，掌握原始数据的清洗与预处理流程。
2. 掌握序列比对的核心原理与常用工具，能够完成从测序数据到比对结果的全流程操作。
3. 了解变异检测、基因定量等下游分析的基本方法，为后续专题学习奠定基础。
培训内容介绍：
1. 高通量测序技术概述：了解二代测序与三代测序的原理差异，熟悉测序数据的产生过程与常见应用场景。
2. 生物信息学基础环境：熟悉Linux操作系统常用命令，掌握生信软件的安装与环境配置方法。
3. 测序数据格式解析：深入理解FASTQ、FASTA、GFF/GTF、SAM/BAM等生物信息学标准文件格式。
4. 数据质量控制与预处理：使用FastQC进行测序数据质量评估，掌握Trimmomatic/Cutadapt进行数据清洗与去接头。
5. 序列比对原理：理解参考基因组索引构建、比对算法原理（BWT、哈希表）及比对结果的解读。
6. 比对工具实战：使用BWA/Bowtie2将测序reads比对到参考基因组，生成SAM文件。
7. 比对后处理：使用SAMtools进行格式转换、排序、索引，生成压缩的BAM文件。
8. 比对结果可视化：使用IGV加载BAM文件，直观查看reads覆盖度、比对质量与变异位点。
9. 变异检测初步：了解SNP/Indel的基本概念，使用GATK或bcftools进行基础的变异位点识别。
10. 基因表达定量初步：了解RNA-seq数据的基本定量原理，生成基因表达计数矩阵。
11. 生信流程自动化：使用Shell脚本串联多个分析步骤，构建简单的自动化分析流程。
12. 综合实战演练：以一个真实的小型测序数据集为例，完成从原始数据到比对结果的完整分析流程。

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服务特点：
海量专家资源，精准匹配相关行业，相关项目专家，针对实际需求，顾问式咨询，互动式授课，案例教学，小班授课，实际项目演示，快捷高效，省时省力省钱。

专家力量：
中国科学院软件研究所，计算研究所高级研究人员
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中科信软培训中心，资深专家或讲师
大多名牌大学，硕士以上学历，相关技术专业，理论素养丰富
多年实际项目经历，大型项目实战案例，热情，乐于技术分享
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